Основные цели и задачи отдела Химико-токсикологии - химико-токсикологические исследования патологического материала, кормов, воды и др. биоматериалов с целью диагностики отравлений животных, санитарно-микологические исследования кормов с диагностической целью, направлено на предупреждение заболеваний, возникающих при скармливании животным кормов, пораженных токсигенными или патогенными микроскопическими грибами, а также для выяснения причин отравлений поголовья скота. А также исследования ветеринарных препаратов, пищевых и других продуктов, с целью сертификации, определенной областью аккредитации как испытательная лаборатория.
Одним из отравляющих факторов животных и птицы является наличие в кормах солей тяжелых металлов, пестицидов, канцерогенных веществ и наличие излишнего или избыточного количества некоторых минеральных элементов. Для определения этих веществ и токсинов используется методы атомно-абсорбционный спектрометрии, спектрофотометрия и хроматографические исследования.
Из года в год увеличивается объем исследований, количество новых методик в производство, обновляется лабораторное оборудование и оснащается более современными и высокоточными приборами. По освоению и внедрению новых методик, приборов отдел всегда занимал и занимает ведущее место в лаборатории. Именно здесь освоен и внедрен впервые в производство метод спектрального анализа микроэлементов и тяжелых металлов, тонкослойная и газожидкостная хроматография и многие другие приборы.
Сегодня в отделе успешно трудятся ветеринарные врачи – Т.А.Шалькова, Р.А.Шабанова, лаборант – Н.В.Батухтина. С 2006 года и по сегодняшний день отделом руководит ветеринарный врач, заведующий отделом - М.Б. Яркаева.
Резко изменилась и усложнилось оснащенность отдела. Сегодня отдел оснащён и работает более современными приборами и оборудованием.
В отделе химико-токсикологии и микологии на сегодня имеются: спектрофотометр «UV mini-1240», атомно-абсорбционный спектрометр «АА-6800», жидкостной хроматограф «LC-20AD» и газовый хроматограф «Кристалл-2000М», микроволновая система для пробоподготовки, разложения и экстракции биоматериала "MDS-6".